艾姆斯，IA - “这项努力是梦想着这一机会的多年的结晶，并最终获得了数据和资金来实现这一目标，”爱荷华州立大学动物科学副教授詹姆斯·E·科尔特斯（James E. Koltes）说。
Koltes指的是他在爱荷华州立大学和几家合作伙伴机构领导的新的USDA支持的项目，以创建一个系统的目录或百科全书，3118云顶集团 Nethereworld科学家称其为“遗传调节区域”。该研究通过鉴定可能在提高动物效率和健康的繁殖中有用的调节性3118云顶集团变异来为重要发现奠定了基础。
“我们已经知道多年来，特征中大多数用于繁殖的遗传变异实际上并不位于基因中，” Koltes说。 “基因以外地区的大部分3118云顶集团基本上是垃圾，但研究表明，其中一些具有重要功能 - 并且包含可遗传的遗传或表观遗传变异，从而改变了动物的外观和性能。”
表观遗传变异是指由于饮食或环境条件等因素改变基因表达但不会改变3118云顶集团结构的因素，因此对3118云顶集团进行了化学修饰。这包括复杂的特征，例如体重，甚至是使物种成为物种的特征。
这些基因脱节区被认为占动物基因组的90％以上。对人类和啮齿动物的研究，包括编码财团，表明3118云顶集团调节区域可以控制基因如何打开和关闭，从而控制生物体生命的不同阶段的重要生长过程，并区分组织和细胞类型。
“我还致力于了解遗传学如何影响奶牛中动物到动物的饲料效率的变化，” Koltes说。 “这是一个复杂的特征，很可能部分由3118云顶集团调节区域调节，而3118云顶集团调节区域不在我们传统上认为是基因的地方。”
Koltes表示，新赠款将集中在牛，猪和绵羊上，尽管该团队将用来对3118云顶集团元素可以对其他物种有效的软件进行分类。他们的最终目标是通过开发新的“开源”注释数据集来帮助加速遗传改善，这些数据集将已知或可能的功能分配给特定的3118云顶集团序列位置，从而为多种物种提供了第一张牲畜调节功能的地图，并在线网站提供了一个网站，以作为信息和培训的家中的家用，以支持其共享。
“除了这些有用的工具外，我们确实正在研究一些新颖的科学，并有可能快速进入应用，”他说。
该项目在未来三年内从美国农业部的农业和食品研究计划中获得了未来三年的$ 800,000。科尔特斯说，新的赠款是从现象倡议（AG2PI）种子赠款项目的农业基因组中诞生的。
他将与其他爱荷华州立动物科学家合作，包括杰出的克里斯·塔格（Chris Tuggle）教授，动物基因组的功能注释（faang），是一项国际协调的努力，旨在创建和分享有关新项目中有关养殖和伴侣动物基因组的许多高质量信息；以及副科学家吉里安格·胡（Zhiliang Hu），工具的主要开发商AnimalGenome.org.
其他合作伙伴是：
- Zhiping Weng，Li Weibo Massachusetts Chan医学院生物医学研究主席，encode和开发人员屏幕，该项目中用于牲畜的关键软件。大约十年前的编码始于人类的基因组，与牲畜的Faang相似。
- Mallory Freeberg，人类基因组学团队负责人，欧洲生物信息学研究所和分子生物学实验室（EMBL-EBI）。
- 布伦达·默多克（Brenda Murdoch），爱达荷大学动物，兽医和食品科学系副教授。
- 密苏里大学动物科学教授Chris Elsik。
联系人：
詹姆斯·科尔特斯（James Koltes），动物科学系，515-294-8274，jekoltes@iastate.edu
Chris Tuggle，动物科学系，515-294-4252，cktuggle@iastate.edu
Ann Y. Robinson，《农业与生命科学通讯》，515-294-3066，，and@iastate.edu